A gestão administrativa e financeira da CONTAG é coordenada pela Secretaria de Finanças e Administração e envolve Assessoria, Setor de Tecnologia, Setor de Contabilidade e Departamento de Pessoal, Setor de Projetos e Convênios, Secretaria Executiva e Gerência do CESIR. A Secretaria de Finanças e Administração tem papel fundamental na implementação e consolidação da política de sustentabilidade político-financeira do Movimento Sindical de Trabalhadores e Trabalhadoras Rurais (MSTTR), assegurando o cumprimento das deliberações congressuais e das definições nacionais.
Para o fortalecimento das entidades sindicais do MSTTR é necessário qualificar a ação político-sindical, com princípios que assegurem práticas democráticas e éticas, articuladas à adoção de mecanismos que efetivem o planejamento estratégico e a transparência na gestão administrativa e financeira. Este processo deve ser participativo, democrático e solidário, e que garanta o trabalho conjunto e a corresponsabilidade entre as instâncias sindicais.