A Comissão Nacional de Ética é responsável pela investigação de denúncias contra dirigentes sindicais que descumprem as deliberações e as regras regimentais e estatutárias do MSTTR. É composta por representantes das cinco Regionais Sindicais e por dirigentes da CONTAG, eleitos pelo Conselho Deliberativo.

As reuniões desta Comissão são convocadas quando há denúncias a serem analisadas.